Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms