Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms