Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms