Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms