Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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