Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms