Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms