Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms