Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPDL3BQ92485 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms