Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms