Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms