Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM47EQ6ZV65 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms