Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM43BQ6ZT52 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms