Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms