Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms