Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms