Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms