Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AMER1Q5JTC6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMER1Q5JTC6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms