Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms