Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms