Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms