Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms