Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF4Q2M2E3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms