Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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