Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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