Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD2Q16342 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms