Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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