Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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