Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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VAMP3Q15836 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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