Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EFNB3Q15768 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EFNB3Q15768 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EFNB3Q15768 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EFNB3Q15768 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNB3Q15768 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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