Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 RCOR3-206ENST00000485186 434 ntTSL 34.25□□□□□ -1.733e-10■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 RCOR3-209ENST00000528066 569 ntTSL 33.71□□□□□ -1.823e-10■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 RAD9A-204ENST00000535644 1624 ntTSL 313.84□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 C1orf159-208ENST00000442117 554 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 RNF44-202ENST00000504160 887 ntTSL 315.58■□□□□ 0.089e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NOP53-206ENST00000598285 265 ntTSL 213.5□□□□□ -0.252e-12■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 313.67□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -13e-7■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.83□□□□□ -1.166e-70■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 SNORD91A-201ENST00000390861 95 nt1.43□□□□□ -2.186e-70■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 PABPC4-208ENST00000461578 193 ntTSL 512.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 PABPC4-212ENST00000477556 413 ntTSL 312.05□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 516.52■□□□□ 0.245e-9■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 215.35■□□□□ 0.055e-9■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.175e-9■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 MTA1-219ENST00000551236 461 ntTSL 310.99□□□□□ -0.655e-9■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 EIF3B-203ENST00000413917 962 ntTSL 218.33■□□□□ 0.523e-11■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 222.24■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 315.75■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 513.87□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 NOL8-206ENST00000433029 1396 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.89□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 NOL8-218ENST00000536624 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.01□□□□□ -1.773e-10■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 OSBPL9-210ENST00000475697 3375 ntTSL 27.15□□□□□ -1.275e-12■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 DMTF1-234ENST00000582925 770 ntTSL 36.07□□□□□ -1.444e-8■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 DMTF1-207ENST00000423590 545 ntTSL 54.86□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 DMTF1-218ENST00000449088 783 ntTSL 54.78□□□□□ -1.644e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 DMTF1-206ENST00000420131 568 ntTSL 44.78□□□□□ -1.644e-8■■■■■ 31.3
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SF3B4Q15427 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.318e-11■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PPP2R5D-201ENST00000230402 2958 ntTSL 211.34□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PPP2R5D-203ENST00000461010 1558 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 322.4■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 315.04■□□□□ -03e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 59.7□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.784e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.54e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.454e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.164e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-211ENST00000538663 552 ntTSL 421.28■■□□□ 14e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NAPB-204ENST00000468128 782 ntTSL 520.1■□□□□ 0.814e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NIP7-205ENST00000563364 436 ntTSL 218.88■□□□□ 0.614e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 518.67■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-209ENST00000536098 563 ntTSL 518.09■□□□□ 0.494e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-217ENST00000541898 1198 ntTSL 217.9■□□□□ 0.464e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-204ENST00000535288 622 ntTSL 417.9■□□□□ 0.464e-9■■■■■ 31.2
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