Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSU1Q15404 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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