Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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RABEP1Q15276 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RABEP1Q15276 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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