Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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