Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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