Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNASE1L3Q13609 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms