Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDAP1Q13442 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDAP1Q13442 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms