Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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