Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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RPA4Q13156 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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RPA4Q13156 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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RPA4Q13156 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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