Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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