Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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