Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms