Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms