Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms