Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms