Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms