Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLCB3Q01970 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms