Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms