Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms