Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms